Graduada en la Universidad de Cambridge y País Vasco, es doctora en Filosofía y ha sido investigadora posdoctoral en la Universidad de Cambridge, Oxford, Edimburgo, London College y Queen en Canadá. Fue directora académica del Máster en Gobernanza y Estudios Políticos en la Universidad del País Vasco, donde obtuvo la plaza de profesora de teoría política. Goikoetxea es actualmente miembro del Centro Internacional de Estudios de Género de la Universidad de Oxford. Fue editora asociada de la University of Cambridge Political Journal y actualmente es editora de la Colección de libros de pensamiento Lisipe, columnista y colaboradora habitual en medios de comunicación nacionales e internacionales. Su libro de poesia Tractatus ganó el premio Lauaxeta de Poesía en 2014. Su última investigación ha sido publicada por Routledge, Springer, Francis & Taylor y Tecnos. Sus últimos libros se titulan Privatizing Democracy (Peter Lang Oxford, Icaria, Elkar, Red Star), Euskal Demokrazia Patriarkala (Elkar, 2020) y Estallidos (Barcelona: Bellaterra, 2021, escito con Noguera). Es co-fundadora del grupo de Teoría Crítica BiBA.